上海哈尔滨商会成立于2008年3月，前身为哈尔滨市总商会上海商会，是经哈尔滨市工商联、哈尔滨市总商会批准的首家异地商会，是由黑龙江籍在沪从事非公经济活动人士组成的非营利性民间组织。2015年1月29日，在上海市社团局完成登记，是上海市首批地市级异地商会，并正式更名为上海哈尔滨商会。
2017年6月，中共上海哈尔滨商会支部委员会成立；2018年、2019-2020年，均被上海市在沪企业（商会）联合会党委评为优秀党支部、标兵党支部；
2021年3月，上海哈尔滨商会荣获“助力哈尔滨市精准扶贫工作优秀组织奖”；
2021年12月，上海哈尔滨商会被评定为上海市5A级社会组织；
2022年10月，上海哈尔滨商会荣获2021-2022年度上海市“四好”商会称号；
2022年10月，上海哈尔滨商会会长王雪松被评为2021-2022年度上海市工商联优秀会长。2024年12月，上海哈尔滨商会荣获2023-2024年度上海市“四好”商会称号；2024年12月，上海哈尔滨商会会长王雪松被评为2023-2024年度上海市工商联优秀会长。
